L’absis central amb el seu espai presbiterial es on es concentra la major decoració. L’interior de l’absis es ornamentat per una succesió d’arcs sobre columnes adossades al mur que arriben fins a la imposta on arrenca la volta de la coberta. En l’absis s’obren també tres finestres amb arcs en degradació i sota la finestra central un petit absidiol que presenta la mateixa decoració que l’absis. Aquest absidiol és un element molt singular dins del romànic català i només s’ha trobat un precedent a l’església del monestir de Sant Pere de Rodes.
Situada dins de l’absidiol trobem la imatge de la Mare de Déu també anomenada Mare de Déu d’Andorra titular de la catedral d’Urgell. Datada de la primera meitat del segle XIII. Es tracta d’una imatge de fusta que representa la mare de Déu asseguda en un escambell amb el Nen a la falda. La mare es manté hieràtica mentre que el fill trenca aquest immobilisme propi del romànic, però es sobretot la cama esquerra mig encreuada en diagonal que humanitza el conjunt. La imatge restaurada en varies ocasions va patir el saqueig francès de 1793 on va ser decapitada i també al 1936. La marededeu actual presenta el cap refet intervenció que es va fer durant una restauració duta a terme als anys quaranta. Santa Maria com a patrona local també es troba representada en l’escut de la ciutat.
