La nau central es la més alta (21 metres) està coberta amb volta de canó de perfil semicircular tota enguixada i reforçada per quatre arcs torals. La volta arrenca d’una imposta correguda suportada per permòdols esculturats.
El dos primers trams de la nau central eren ocupats pel cor, fins que va ser traslladat al 1915 al presbiteri. El cadirat del cor va ser contractat al 1410 per Pere de Sant Joan, escultor i arquitecte que havia estat mestre entre altres de la catedral de Girona. Estava format per dues fileres, amb 60 cadires altes i 42 de baixes a més d’un gran seien de 4 metres d’alt, l’unic amb misericòdia figurada. El cadirat va ser reformat al segle XVI. Al 1915 durant la restauració de Puig i Cadafalch es va desmuntar i partir d’aleshores es va anar dividint en diferents col•leccions d’arreu. Del conjunt han estat localitzades un grup de cadires que es troben al Museo Lázaro Galdeano de Madrid i un altre lot de cadires a la mansió del magnat nord-americà William Radolph Hearst a California.
